Le STDF est financé par des contributions volontaires au Fonds d'affectation spéciale établi conformément au règlement financier et aux règles de gestion financières de l'OMC. Dans le cadre de la Stratégie à moyen terme actuelle du STDF 2015-2019, un niveau de financement annuel de 5 millions de dollars EU a été fixé comme objectif.
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Le Taipei chinois est Membre de l'OMC en vertu de l'article XII de l'Accord de Marrakech (1994). Le statut de Membre de l'OMC n'a aucune incidence sur la souveraineté du Membre au regard du droit international.